Wyrok ogłoszono 21 wirześnia 1953 roku. Biskupa Kaczmarka skazano na 12 lat więzienia. Był poddany wyjątkowo okrutnym torturom - nie tylko fizycznym, ale też psychicznym. Był całkowicie izolowany. Wmawiano mu, że episkopat odciął się od niego. 

Cztery dni po wyroku na bp Kaczmarka doszło do aresztowania Prymasa Wyszyńskiego. Jako jeden z powodów represji wobec biskupa kieleckiego było jego stanowisko w sprawie pogromu w roku 1946. Biskup w swoim raporcie pisał, że taki pogrom byłby na rękę urzędnikom bezpieczeństwa wewnętrznego.

Bp Kaczmarek wrócił na na swoją stolicę biskupią po śmierci prezydenta Bieruta. Zmarł w roku 1963 w Lublinie.

ToR/ks. Jan Śledzianowski, "Ksiądz Czesław Kaczmarek - biskup kielecki", Kielce 1991.